Bioinformatické algoritmy TIN084

• Sylabus TIN084
• Cvičenie
• Slidy k prednáške
• Prezentácie projektov z cvičení
• Odkazy k prednáške

Cvičenie k prednáške

• 1. časť úloh
• 2. časť úloh
• 3. časť úloh
• Fragment ľudského chromozómu č. 1
• Kompresia DNA a určovanie príbuznosti organizmov
• Alignment sekvencií

Slidy k prednáške (nové: k súborom v PDF je možné pridávať komentáre a poznámky)

• Biologiké motivácie ( pdf)
• Restrikčné mapy ( pdf)
• Pravdepodobnosť ( pdf)
• Komprimácia ( pdf)
• Preusporiadanie genómu ( pdf)
• Porovnávanie sekvencií DNA - editačná vzdialenosť, globálne a lokálne zarovnanie, afinné pokuty za diery ( pdf)
• BLAST a FASTA ( pdf)
• hľadanie motívov ( pdf)

---

nižšie nasledujú staré slidy

---

• Predikcia génov ( pdf)
• Markovské modely ( pdf)

Prezentácie projektov z cvičení

Odkazy

• C. Jones, A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms
• Bioinformatics in Wikipedia, the free encyclopedia
• H. štorchová: Metody analýzy DNA v botanice
• Bioinformatics Organization, Inc.
• European Bioinformatics Institute
• Bio slovníček