Bioinformatické algoritmy TIN084
Sylabus
TIN084
Cvičenie
Slidy k prednáške
Prezentácie projektov z cvičení
Odkazy k prednáške
Cvičenie k prednáške
Úlohy na cvičenie:
1. časť úloh
2. časť úloh
3. časť úloh
Fragment ľudského chromozómu č. 1
Kompresia DNA a určovanie príbuznosti organizmov
Alignment sekvencií
Slidy k prednáške (
nové:
k súborom v PDF je možné pridávať komentáre a poznámky)
Biologiké motivácie (
pdf
)
Restrikčné mapy (
pdf
)
Pravdepodobnosť (
pdf
)
Komprimácia (
pdf
)
Preusporiadanie genómu (
pdf
)
Porovnávanie sekvencií DNA - editačná vzdialenosť, globálne a lokálne zarovnanie, afinné pokuty za diery (
pdf
)
BLAST a FASTA (
pdf
)
hľadanie motívov (
pdf
)
nižšie nasledujú staré slidy
Predikcia génov (
pdf
)
Markovské modely (
pdf
)
Prezentácie projektov z cvičení
Prezentácie sú na zvláštnej
stránke
.
Odkazy
C. Jones, A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms
Bioinformatics in Wikipedia, the free encyclopedia
H. štorchová: Metody analýzy DNA v botanice
Bioinformatics Organization, Inc.
European Bioinformatics Institute
Bio slovníček